Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms