Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C8

LILRA3, Leukocyte immunoglobulin-like receptor subfamily A member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LILRA3Q8N6C8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms