Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
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