Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMYD4Q8IYR2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMYD4Q8IYR2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms