Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW00

VSTM4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4Q8IW00 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSTM4Q8IW00 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms