Protein–RNA interactions for Protein: Q86UF1

TSPAN33, Tetraspanin-33, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN33Q86UF1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN33Q86UF1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms