Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms