Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A10Q6U841 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms