Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZCCHC12Q6PEW1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms