Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TYW3Q6IPR3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TYW3Q6IPR3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TYW3Q6IPR3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TYW3Q6IPR3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TYW3Q6IPR3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TYW3Q6IPR3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TYW3Q6IPR3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TYW3Q6IPR3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TYW3Q6IPR3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TYW3Q6IPR3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TYW3Q6IPR3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TYW3Q6IPR3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TYW3Q6IPR3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TYW3Q6IPR3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TYW3Q6IPR3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TYW3Q6IPR3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TYW3Q6IPR3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TYW3Q6IPR3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TYW3Q6IPR3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TYW3Q6IPR3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TYW3Q6IPR3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TYW3Q6IPR3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TYW3Q6IPR3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TYW3Q6IPR3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TYW3Q6IPR3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TYW3Q6IPR3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TYW3Q6IPR3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms