Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATL3Q6DD88 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms