Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM1

ZNF678, Zinc finger protein 678, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF678Q5SXM1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF678Q5SXM1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms