Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPANXN3Q5MJ09 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPANXN3Q5MJ09 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPANXN3Q5MJ09 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms