Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR44Q5JSH3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms