Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0Z9

MCMDC2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMDC2Q4G0Z9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCMDC2Q4G0Z9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCMDC2Q4G0Z9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCMDC2Q4G0Z9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCMDC2Q4G0Z9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCMDC2Q4G0Z9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCMDC2Q4G0Z9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCMDC2Q4G0Z9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MCMDC2Q4G0Z9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCMDC2Q4G0Z9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCMDC2Q4G0Z9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCMDC2Q4G0Z9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCMDC2Q4G0Z9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCMDC2Q4G0Z9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCMDC2Q4G0Z9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCMDC2Q4G0Z9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCMDC2Q4G0Z9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCMDC2Q4G0Z9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCMDC2Q4G0Z9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
MCMDC2Q4G0Z9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCMDC2Q4G0Z9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCMDC2Q4G0Z9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MCMDC2Q4G0Z9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MCMDC2Q4G0Z9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCMDC2Q4G0Z9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCMDC2Q4G0Z9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCMDC2Q4G0Z9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCMDC2Q4G0Z9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCMDC2Q4G0Z9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCMDC2Q4G0Z9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCMDC2Q4G0Z9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCMDC2Q4G0Z9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCMDC2Q4G0Z9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCMDC2Q4G0Z9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCMDC2Q4G0Z9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCMDC2Q4G0Z9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCMDC2Q4G0Z9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCMDC2Q4G0Z9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MCMDC2Q4G0Z9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCMDC2Q4G0Z9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCMDC2Q4G0Z9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCMDC2Q4G0Z9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCMDC2Q4G0Z9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCMDC2Q4G0Z9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCMDC2Q4G0Z9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCMDC2Q4G0Z9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCMDC2Q4G0Z9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCMDC2Q4G0Z9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCMDC2Q4G0Z9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms