Protein–RNA interactions for Protein: Q3MJ16

PLA2G4E, Cytosolic phospholipase A2 epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4EQ3MJ16 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PLA2G4EQ3MJ16 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLA2G4EQ3MJ16 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLA2G4EQ3MJ16 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLA2G4EQ3MJ16 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLA2G4EQ3MJ16 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLA2G4EQ3MJ16 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLA2G4EQ3MJ16 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLA2G4EQ3MJ16 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLA2G4EQ3MJ16 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLA2G4EQ3MJ16 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLA2G4EQ3MJ16 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLA2G4EQ3MJ16 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLA2G4EQ3MJ16 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLA2G4EQ3MJ16 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLA2G4EQ3MJ16 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLA2G4EQ3MJ16 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLA2G4EQ3MJ16 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLA2G4EQ3MJ16 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLA2G4EQ3MJ16 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms