Protein–RNA interactions for Protein: Q3MJ13

WDR72, WD repeat-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR72Q3MJ13 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR72Q3MJ13 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR72Q3MJ13 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR72Q3MJ13 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR72Q3MJ13 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR72Q3MJ13 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR72Q3MJ13 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR72Q3MJ13 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR72Q3MJ13 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR72Q3MJ13 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR72Q3MJ13 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR72Q3MJ13 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR72Q3MJ13 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR72Q3MJ13 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR72Q3MJ13 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR72Q3MJ13 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms