Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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