Protein–RNA interactions for Protein: Q15291

RBBP5, Retinoblastoma-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP5Q15291 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBBP5Q15291 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP5Q15291 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms