Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMC1AQ14683 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms