Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME3Q13232 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME3Q13232 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME3Q13232 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME3Q13232 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NME3Q13232 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NME3Q13232 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NME3Q13232 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NME3Q13232 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NME3Q13232 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NME3Q13232 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NME3Q13232 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NME3Q13232 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME3Q13232 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME3Q13232 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME3Q13232 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME3Q13232 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME3Q13232 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME3Q13232 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME3Q13232 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NME3Q13232 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NME3Q13232 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NME3Q13232 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NME3Q13232 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NME3Q13232 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NME3Q13232 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NME3Q13232 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME3Q13232 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME3Q13232 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME3Q13232 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME3Q13232 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME3Q13232 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME3Q13232 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME3Q13232 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME3Q13232 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME3Q13232 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME3Q13232 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME3Q13232 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME3Q13232 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME3Q13232 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME3Q13232 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME3Q13232 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME3Q13232 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME3Q13232 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME3Q13232 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME3Q13232 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME3Q13232 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME3Q13232 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME3Q13232 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME3Q13232 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME3Q13232 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME3Q13232 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME3Q13232 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME3Q13232 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME3Q13232 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME3Q13232 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME3Q13232 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME3Q13232 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME3Q13232 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME3Q13232 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME3Q13232 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME3Q13232 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME3Q13232 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME3Q13232 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME3Q13232 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME3Q13232 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME3Q13232 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME3Q13232 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME3Q13232 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME3Q13232 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME3Q13232 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME3Q13232 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME3Q13232 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME3Q13232 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME3Q13232 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME3Q13232 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NME3Q13232 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME3Q13232 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME3Q13232 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME3Q13232 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME3Q13232 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME3Q13232 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME3Q13232 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME3Q13232 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME3Q13232 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME3Q13232 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NME3Q13232 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME3Q13232 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME3Q13232 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME3Q13232 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME3Q13232 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME3Q13232 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME3Q13232 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME3Q13232 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME3Q13232 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME3Q13232 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME3Q13232 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME3Q13232 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME3Q13232 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME3Q13232 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
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