Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRDNQ13061 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms