Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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