Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms