Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms