Protein–RNA interactions for Protein: P89113

DDR2, Protein DDR2, yeast

Predictions only

Length 61 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	P89113	SSH1	YBR283C	1473 nt		2.75	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	TPA1	YER049W	1935 nt		2.75	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	GUF1	YLR289W	1938 nt		2.74	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	LAS21	YJL062W	2493 nt		2.74	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	PTC1	YDL006W	846 nt		2.74	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	FRA2	YGL220W	363 nt		2.74	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	MRP4	YHL004W	1185 nt		2.74	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	FMP46	YKR049C	402 nt		2.74	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	PNP1	YLR209C	936 nt		2.74	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	AST1	YBL069W	1290 nt		2.74	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	YNL296W	YNL296W	315 nt		2.74	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	RGS2	YOR107W	930 nt		2.74	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	DPH6	YLR143W	2058 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	PDR12	YPL058C	4536 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	RAM1	YDL090C	1296 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	RPC53	YDL150W	1269 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	NBP2	YDR162C	711 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	YLR374C	YLR374C	390 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	CUZ1	YNL155W	825 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	YBR016W	YBR016W	387 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	MGR2	YPL098C	342 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	VPS69	YPR087W	321 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	STP22	YCL008C	1158 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	SEC18	YBR080C	2277 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	PRP9	YDL030W	1593 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	AIM17	YHL021C	1398 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	YPL277C	YPL277C	1464 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	SRO7	YPR032W	3102 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	AAD6	YFL056C	639 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	LSB1	YGR136W	726 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	EFB1	YAL003W	621 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	ISY1	YJR050W	708 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	SSH4	YKL124W	1740 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	COX17	YLL009C	210 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	HEK2	YBL032W	1146 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	ATF1	YOR377W	1578 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	CHL1	YPL008W	2586 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	SSB1	YDL229W	1842 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	ARG4	YHR018C	1392 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	SUL2	YLR092W	2682 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	ECM22	YLR228C	2445 nt		2.71	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	PHM7	YOL084W	2976 nt		2.71	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	YAL056C-A	YAL056C-A	351 nt		2.71	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	YBL059W	YBL059W	582 nt		2.71	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	URE2	YNL229C	1065 nt		2.71	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	FSH3	YOR280C	801 nt		2.71	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	CDC14	YFR028C	1656 nt		2.71	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	MET3	YJR010W	1536 nt		2.71	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	MST1	YKL194C	1389 nt		2.71	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	SAC1	YKL212W	1872 nt		2.71	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	SSA2	YLL024C	1920 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	MNN4	YKL201C	3537 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	CTS2	YDR371W	1536 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	ADY3	YDL239C	2373 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	ELO2	YCR034W	1044 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	RXT3	YDL076C	885 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	RPS11A	YDR025W	471 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	SPC19	YDR201W	498 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	SEC72	YLR292C	582 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	YMR105W-A	YMR105W-A	195 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	HEM15	YOR176W	1182 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	CEG1	YGL130W	1380 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	BIK1	YCL029C	1323 nt		2.69	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	RFC2	YJR068W	1062 nt		2.69	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	YNG1	YOR064C	660 nt		2.69	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	PDX3	YBR035C	687 nt		2.69	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	LYP1	YNL268W	1836 nt		2.69	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	SRP72	YPL210C	1923 nt		2.69	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	VMA1	YDL185W	3216 nt		2.69	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	YCF1	YDR135C	4548 nt		2.69	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	AFT1	YGL071W	2073 nt		2.69	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	GAL11	YOL051W	3246 nt		2.68	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	URA3	YEL021W	804 nt		2.68	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	YIL171W-A	YIL171W-A	453 nt		2.68	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	IRC9	YJL142C	393 nt		2.68	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	YJL220W	YJL220W	453 nt		2.68	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	NMD4	YLR363C	657 nt		2.68	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	CCS1	YMR038C	750 nt		2.68	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	YMR114C	YMR114C	1107 nt		2.68	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	YMR130W	YMR130W	909 nt		2.68	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	UTP23	YOR004W	765 nt		2.68	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	GDT1	YBR187W	843 nt		2.68	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	YLH47	YPR125W	1365 nt		2.68	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	ACE2	YLR131C	2313 nt		2.68	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	VHS2	YIL135C	1311 nt		2.68	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	SPC105	YGL093W	2754 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	ALG9	YNL219C	1668 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	RPB2	YOR151C	3675 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	MDM34	YGL219C	1380 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	tR(ACG)J	tR(ACG)J	73 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	ATG33	YLR356W	594 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	YLR364C-A	YLR364C-A	123 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	RRN9	YMR270C	1098 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	RRP40	YOL142W	723 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	YOR379C	YOR379C	339 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	YBR056W-A	YBR056W-A	201 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	YPL278C	YPL278C	303 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	YEH2	YLR020C	1617 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	ERG4	YGL012W	1422 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DDR2	P89113	TRM11	YOL124C	1302 nt		2.67	□□□□□ -1.98

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