Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMC1P62191 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms