Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB38P57729 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB38P57729 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB38P57729 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB38P57729 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB38P57729 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB38P57729 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB38P57729 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB38P57729 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB38P57729 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB38P57729 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB38P57729 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB38P57729 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB38P57729 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB38P57729 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB38P57729 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB38P57729 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB38P57729 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB38P57729 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB38P57729 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB38P57729 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB38P57729 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB38P57729 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB38P57729 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB38P57729 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB38P57729 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB38P57729 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB38P57729 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB38P57729 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB38P57729 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB38P57729 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB38P57729 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB38P57729 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB38P57729 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB38P57729 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB38P57729 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB38P57729 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB38P57729 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB38P57729 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB38P57729 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB38P57729 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB38P57729 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB38P57729 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB38P57729 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB38P57729 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB38P57729 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB38P57729 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB38P57729 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB38P57729 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB38P57729 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB38P57729 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB38P57729 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB38P57729 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB38P57729 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB38P57729 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB38P57729 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB38P57729 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB38P57729 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB38P57729 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB38P57729 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB38P57729 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB38P57729 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB38P57729 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB38P57729 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB38P57729 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB38P57729 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB38P57729 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB38P57729 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB38P57729 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB38P57729 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB38P57729 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB38P57729 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB38P57729 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB38P57729 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB38P57729 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB38P57729 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB38P57729 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB38P57729 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB38P57729 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB38P57729 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB38P57729 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB38P57729 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB38P57729 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB38P57729 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB38P57729 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB38P57729 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB38P57729 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB38P57729 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB38P57729 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB38P57729 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB38P57729 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB38P57729 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB38P57729 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB38P57729 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB38P57729 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB38P57729 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB38P57729 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB38P57729 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB38P57729 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB38P57729 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms