Protein–RNA interactions for Protein: P56589

PEX3, Peroxisomal biogenesis factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX3P56589 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PEX3P56589 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PEX3P56589 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PEX3P56589 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PEX3P56589 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX3P56589 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX3P56589 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX3P56589 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX3P56589 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX3P56589 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX3P56589 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX3P56589 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX3P56589 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX3P56589 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PEX3P56589 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PEX3P56589 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PEX3P56589 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PEX3P56589 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PEX3P56589 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PEX3P56589 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX3P56589 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX3P56589 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX3P56589 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX3P56589 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX3P56589 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX3P56589 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX3P56589 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX3P56589 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX3P56589 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX3P56589 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX3P56589 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX3P56589 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX3P56589 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX3P56589 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX3P56589 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX3P56589 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX3P56589 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX3P56589 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX3P56589 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX3P56589 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PEX3P56589 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PEX3P56589 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PEX3P56589 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PEX3P56589 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PEX3P56589 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PEX3P56589 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PEX3P56589 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PEX3P56589 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PEX3P56589 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PEX3P56589 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PEX3P56589 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PEX3P56589 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX3P56589 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX3P56589 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX3P56589 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX3P56589 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX3P56589 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX3P56589 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX3P56589 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX3P56589 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX3P56589 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX3P56589 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX3P56589 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX3P56589 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX3P56589 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX3P56589 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX3P56589 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX3P56589 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX3P56589 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX3P56589 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX3P56589 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX3P56589 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX3P56589 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX3P56589 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX3P56589 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX3P56589 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX3P56589 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX3P56589 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX3P56589 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX3P56589 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX3P56589 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX3P56589 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX3P56589 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX3P56589 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX3P56589 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX3P56589 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX3P56589 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX3P56589 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX3P56589 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX3P56589 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX3P56589 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX3P56589 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX3P56589 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX3P56589 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX3P56589 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX3P56589 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX3P56589 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX3P56589 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX3P56589 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX3P56589 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms