Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NAPAP54920 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NAPAP54920 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NAPAP54920 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NAPAP54920 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NAPAP54920 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NAPAP54920 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NAPAP54920 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NAPAP54920 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NAPAP54920 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NAPAP54920 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NAPAP54920 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NAPAP54920 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NAPAP54920 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NAPAP54920 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NAPAP54920 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NAPAP54920 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NAPAP54920 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NAPAP54920 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NAPAP54920 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NAPAP54920 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NAPAP54920 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NAPAP54920 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NAPAP54920 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NAPAP54920 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NAPAP54920 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NAPAP54920 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NAPAP54920 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NAPAP54920 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NAPAP54920 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NAPAP54920 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NAPAP54920 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NAPAP54920 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NAPAP54920 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NAPAP54920 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NAPAP54920 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NAPAP54920 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NAPAP54920 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NAPAP54920 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NAPAP54920 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NAPAP54920 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NAPAP54920 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NAPAP54920 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NAPAP54920 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NAPAP54920 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NAPAP54920 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NAPAP54920 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NAPAP54920 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NAPAP54920 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NAPAP54920 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NAPAP54920 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NAPAP54920 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NAPAP54920 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NAPAP54920 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NAPAP54920 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NAPAP54920 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NAPAP54920 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NAPAP54920 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NAPAP54920 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NAPAP54920 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NAPAP54920 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NAPAP54920 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NAPAP54920 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NAPAP54920 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NAPAP54920 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NAPAP54920 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NAPAP54920 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NAPAP54920 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NAPAP54920 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NAPAP54920 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NAPAP54920 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NAPAP54920 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NAPAP54920 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NAPAP54920 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NAPAP54920 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NAPAP54920 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NAPAP54920 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NAPAP54920 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NAPAP54920 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NAPAP54920 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NAPAP54920 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NAPAP54920 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NAPAP54920 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NAPAP54920 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NAPAP54920 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NAPAP54920 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NAPAP54920 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NAPAP54920 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NAPAP54920 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NAPAP54920 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NAPAP54920 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NAPAP54920 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NAPAP54920 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NAPAP54920 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NAPAP54920 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NAPAP54920 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NAPAP54920 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NAPAP54920 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NAPAP54920 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NAPAP54920 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms