Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms