Protein–RNA interactions for Protein: P49643

PRIM2, DNA primase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM2P49643 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRIM2P49643 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRIM2P49643 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRIM2P49643 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRIM2P49643 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRIM2P49643 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRIM2P49643 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRIM2P49643 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRIM2P49643 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRIM2P49643 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRIM2P49643 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRIM2P49643 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRIM2P49643 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRIM2P49643 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRIM2P49643 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRIM2P49643 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRIM2P49643 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRIM2P49643 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRIM2P49643 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRIM2P49643 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRIM2P49643 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRIM2P49643 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRIM2P49643 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRIM2P49643 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRIM2P49643 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRIM2P49643 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRIM2P49643 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRIM2P49643 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRIM2P49643 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRIM2P49643 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRIM2P49643 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRIM2P49643 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRIM2P49643 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRIM2P49643 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRIM2P49643 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRIM2P49643 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRIM2P49643 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms