Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEDD4P46934 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms