Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms