Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ZEB1P37275 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ZEB1P37275 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ZEB1P37275 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZEB1P37275 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms