Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA7P36544 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms