Protein–RNA interactions for Protein: P35520

CBS, Cystathionine beta-synthase, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSP35520 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBSP35520 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBSP35520 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBSP35520 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBSP35520 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBSP35520 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CBSP35520 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBSP35520 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBSP35520 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBSP35520 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBSP35520 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBSP35520 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBSP35520 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBSP35520 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBSP35520 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBSP35520 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBSP35520 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBSP35520 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBSP35520 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBSP35520 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBSP35520 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBSP35520 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBSP35520 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CBSP35520 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBSP35520 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBSP35520 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBSP35520 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBSP35520 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBSP35520 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBSP35520 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBSP35520 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBSP35520 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBSP35520 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBSP35520 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBSP35520 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBSP35520 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBSP35520 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBSP35520 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBSP35520 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBSP35520 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CBSP35520 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBSP35520 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBSP35520 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBSP35520 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBSP35520 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBSP35520 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBSP35520 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBSP35520 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBSP35520 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBSP35520 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBSP35520 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBSP35520 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBSP35520 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBSP35520 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBSP35520 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBSP35520 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBSP35520 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CBSP35520 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBSP35520 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBSP35520 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBSP35520 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBSP35520 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBSP35520 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBSP35520 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBSP35520 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBSP35520 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBSP35520 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBSP35520 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBSP35520 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBSP35520 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSP35520 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSP35520 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSP35520 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSP35520 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSP35520 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSP35520 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSP35520 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSP35520 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSP35520 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSP35520 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSP35520 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSP35520 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSP35520 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSP35520 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSP35520 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSP35520 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBSP35520 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBSP35520 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBSP35520 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBSP35520 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBSP35520 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBSP35520 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBSP35520 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBSP35520 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CBSP35520 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBSP35520 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBSP35520 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBSP35520 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBSP35520 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBSP35520 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms