Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR1P32246 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR1P32246 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR1P32246 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR1P32246 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR1P32246 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR1P32246 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR1P32246 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR1P32246 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR1P32246 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR1P32246 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR1P32246 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR1P32246 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR1P32246 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR1P32246 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR1P32246 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR1P32246 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR1P32246 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR1P32246 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR1P32246 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR1P32246 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR1P32246 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR1P32246 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR1P32246 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR1P32246 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR1P32246 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR1P32246 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR1P32246 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR1P32246 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR1P32246 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR1P32246 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR1P32246 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR1P32246 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR1P32246 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR1P32246 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR1P32246 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR1P32246 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR1P32246 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR1P32246 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR1P32246 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR1P32246 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR1P32246 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR1P32246 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR1P32246 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR1P32246 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR1P32246 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR1P32246 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR1P32246 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR1P32246 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCR1P32246 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCR1P32246 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCR1P32246 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCR1P32246 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCR1P32246 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCR1P32246 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCR1P32246 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCR1P32246 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR1P32246 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR1P32246 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR1P32246 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR1P32246 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR1P32246 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR1P32246 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR1P32246 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR1P32246 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR1P32246 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR1P32246 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR1P32246 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR1P32246 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR1P32246 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR1P32246 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR1P32246 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR1P32246 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR1P32246 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR1P32246 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR1P32246 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR1P32246 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR1P32246 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR1P32246 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR1P32246 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR1P32246 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR1P32246 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR1P32246 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR1P32246 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR1P32246 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR1P32246 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR1P32246 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR1P32246 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR1P32246 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR1P32246 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR1P32246 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR1P32246 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR1P32246 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR1P32246 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR1P32246 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR1P32246 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR1P32246 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR1P32246 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR1P32246 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR1P32246 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms