Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNGA1P29973 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGA1P29973 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms