Protein–RNA interactions for Protein: P27824

CANX, Calnexin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CANXP27824 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CANXP27824 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CANXP27824 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CANXP27824 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CANXP27824 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CANXP27824 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CANXP27824 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CANXP27824 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CANXP27824 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CANXP27824 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CANXP27824 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CANXP27824 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CANXP27824 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CANXP27824 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CANXP27824 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CANXP27824 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CANXP27824 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CANXP27824 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CANXP27824 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CANXP27824 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CANXP27824 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CANXP27824 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CANXP27824 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CANXP27824 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CANXP27824 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CANXP27824 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CANXP27824 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CANXP27824 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CANXP27824 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CANXP27824 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CANXP27824 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CANXP27824 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CANXP27824 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CANXP27824 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CANXP27824 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CANXP27824 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CANXP27824 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CANXP27824 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CANXP27824 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CANXP27824 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CANXP27824 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CANXP27824 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CANXP27824 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CANXP27824 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CANXP27824 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CANXP27824 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CANXP27824 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CANXP27824 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CANXP27824 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CANXP27824 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CANXP27824 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CANXP27824 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CANXP27824 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CANXP27824 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CANXP27824 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CANXP27824 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CANXP27824 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CANXP27824 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CANXP27824 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CANXP27824 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CANXP27824 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CANXP27824 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CANXP27824 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CANXP27824 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CANXP27824 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CANXP27824 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CANXP27824 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CANXP27824 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CANXP27824 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CANXP27824 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CANXP27824 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CANXP27824 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CANXP27824 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CANXP27824 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CANXP27824 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CANXP27824 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CANXP27824 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CANXP27824 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CANXP27824 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CANXP27824 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CANXP27824 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CANXP27824 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CANXP27824 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CANXP27824 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CANXP27824 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CANXP27824 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CANXP27824 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CANXP27824 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CANXP27824 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CANXP27824 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CANXP27824 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CANXP27824 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CANXP27824 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CANXP27824 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CANXP27824 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CANXP27824 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CANXP27824 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CANXP27824 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CANXP27824 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CANXP27824 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms