Protein–RNA interactions for Protein: P26196

DDX6, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX6P26196 MGAT1-222ENST00000513431 555 ntTSL 219.28■□□□□ 0.681e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 MGAT4B-222ENST00000523329 543 ntTSL 317.87■□□□□ 0.451e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 TUBB2A-202ENST00000489942 817 ntTSL 217.06■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 MGAT1-216ENST00000508702 313 ntTSL 416.73■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 MGAT1-217ENST00000510341 553 ntTSL 416.73■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 SNRNP35-204ENST00000527158 2161 ntTSL 1 (best)16.33■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.043e-14■■■■■ 30.5
DDX6P26196 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 MGAT4B-210ENST00000519965 524 ntTSL 313.88□□□□□ -0.191e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 MGAT1-218ENST00000510962 445 ntTSL 512.94□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.411e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.461e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 MGAT1-207ENST00000504385 540 ntTSL 412.05□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 SNRNP35-202ENST00000412157 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.51e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 SNRNP35-201ENST00000350887 942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.51e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 SNRNP35-203ENST00000526639 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.521e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 MGAT1-219ENST00000512080 532 ntTSL 511.77□□□□□ -0.531e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 AC099811.2-202ENST00000592248 694 ntTSL 310.65□□□□□ -0.71e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 AC099811.2-201ENST00000585562 646 ntTSL 39.45□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 MGAT1-212ENST00000506708 745 ntTSL 28.73□□□□□ -1.011e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 MGAT1-221ENST00000513149 356 ntTSL 47.54□□□□□ -1.21e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 MGAT1-225ENST00000514760 613 ntTSL 37.43□□□□□ -1.221e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 MGAT1-215ENST00000508090 475 ntTSL 44.92□□□□□ -1.621e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 AL121845.3-202ENST00000632538 872 ntAPPRIS P1 TSL 322.28■■□□□ 1.162e-6■■■■■ 30.5
DDX6P26196 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 30.5
DDX6P26196 PRRC2A-213ENST00000487839 1071 ntTSL 510.37□□□□□ -0.751e-8■■■■■ 30.5
DDX6P26196 DDAH2-216ENST00000437288 724 ntTSL 513.21□□□□□ -0.292e-24■■■■■ 30.5
DDX6P26196 SERTAD3-205ENST00000601217 398 ntTSL 315.56■□□□□ 0.084e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.067e-7■■■■■ 30.4
DDX6P26196 MGAT5-201ENST00000281923 8144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -12e-12■■■■■ 30.4
DDX6P26196 MGAT5-202ENST00000409645 8252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.082e-12■■■■■ 30.4
DDX6P26196 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.35e-10■■■■■ 30.4
DDX6P26196 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.174e-8■■■■■ 30.4
DDX6P26196 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.224e-8■■■■■ 30.4
DDX6P26196 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.444e-8■■■■■ 30.4
DDX6P26196 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.224e-8■■■■■ 30.3
DDX6P26196 TMEM2-204ENST00000377057 2637 ntTSL 29.36□□□□□ -0.914e-8■■■■■ 30.3
DDX6P26196 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.691e-8■■■■■ 30.3
DDX6P26196 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.741e-8■■■■■ 30.3
DDX6P26196 YWHAZ-221ENST00000523131 567 ntTSL 522.18■■□□□ 1.142e-7■■■■■ 30.3
DDX6P26196 YWHAZ-208ENST00000418997 996 ntTSL 221.71■■□□□ 1.072e-7■■■■■ 30.3
DDX6P26196 YWHAZ-223ENST00000523938 626 ntTSL 521.35■■□□□ 1.012e-7■■■■■ 30.3
DDX6P26196 YWHAZ-210ENST00000437293 701 ntTSL 320.43■□□□□ 0.862e-7■■■■■ 30.3
DDX6P26196 YWHAZ-202ENST00000395948 812 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.862e-7■■■■■ 30.3
DDX6P26196 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.056e-20■■■■■ 30.3
DDX6P26196 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.246e-20■■■■■ 30.3
DDX6P26196 SRSF5-215ENST00000556587 1863 ntTSL 1 (best)12.44□□□□□ -0.426e-20■■■■■ 30.3
DDX6P26196 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.476e-20■■■■■ 30.3
DDX6P26196 SRSF5-217ENST00000557154 1500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.76e-20■■■■■ 30.3
DDX6P26196 SRSF5-208ENST00000554929 947 ntTSL 210.5□□□□□ -0.736e-20■■■■■ 30.3
DDX6P26196 SRSF5-216ENST00000556647 644 ntTSL 210.5□□□□□ -0.736e-20■■■■■ 30.3
DDX6P26196 SRSF5-207ENST00000554465 3044 ntTSL 1 (best)8.4□□□□□ -1.066e-20■■■■■ 30.3
DDX6P26196 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.742e-9■■■■■ 30.2
DDX6P26196 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.016e-8■■■■■ 30
DDX6P26196 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.186e-8■■■■■ 30
DDX6P26196 DCAF11-203ENST00000396941 2402 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.386e-8■■■■■ 30
DDX6P26196 DCAF11-212ENST00000558624 2627 ntTSL 212.34□□□□□ -0.436e-8■■■■■ 30
DDX6P26196 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.476e-8■■■■■ 30
DDX6P26196 DCAF11-205ENST00000557802 4202 ntTSL 1 (best)12.03□□□□□ -0.486e-8■■■■■ 30
DDX6P26196 DCAF11-201ENST00000326009 2570 ntTSL 1 (best)11.89□□□□□ -0.516e-8■■■■■ 30
DDX6P26196 DCAF11-202ENST00000396936 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.546e-8■■■■■ 30
DDX6P26196 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.435e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 SRCIN1-211ENST00000612431 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)23.87■■□□□ 1.415e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.215e-9■■■■■ 30
DDX6P26196 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.58■■□□□ 1.215e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.121e-6■■■■■ 30
DDX6P26196 MAFK-202ENST00000403150 2773 ntTSL 221.36■■□□□ 1.015e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 15e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.865e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 CDC42-204ENST00000411827 597 ntTSL 319.55■□□□□ 0.725e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.715e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.715e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.645e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 H2AFX-201ENST00000375167 1373 ntTSL 218.98■□□□□ 0.631e-6■■■■■ 30
DDX6P26196 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.595e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.585e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 HSPH1-208ENST00000629751 1034 ntTSL 218.6■□□□□ 0.575e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 SQLE-205ENST00000521232 711 ntTSL 318.23■□□□□ 0.513e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 KANSL1-233ENST00000640519 1970 ntTSL 317.59■□□□□ 0.415e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.345e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 SMYD3-210ENST00000470863 983 ntTSL 216.95■□□□□ 0.35e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 KANSL1-207ENST00000573682 358 ntTSL 316.81■□□□□ 0.285e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 KANSL1-230ENST00000639805 557 ntTSL 416.81■□□□□ 0.285e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.287e-12■■■■■ 30
DDX6P26196 BTG2-202ENST00000475157 1275 ntTSL 516.46■□□□□ 0.233e-8■■■■■ 30
DDX6P26196 KANSL1-219ENST00000638291 745 ntTSL 516.36■□□□□ 0.215e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 KANSL1-223ENST00000639150 1815 ntTSL 516.23■□□□□ 0.195e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.175e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 MFSD5-204ENST00000551660 1318 ntTSL 216.05■□□□□ 0.165e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.165e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.082e-18■■■■■ 30
DDX6P26196 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.085e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.065e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.065e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 KANSL1-227ENST00000639467 677 ntTSL 515.01□□□□□ -0.015e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 KANSL1-235ENST00000640751 464 ntTSL 515.01□□□□□ -0.015e-7■■■■■ 30
Retrieved 100 of 14,483 protein–RNA pairs in 145.3 ms