Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
S100A1P23297 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
S100A1P23297 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
S100A1P23297 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
S100A1P23297 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
S100A1P23297 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
S100A1P23297 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
S100A1P23297 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
S100A1P23297 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
S100A1P23297 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
S100A1P23297 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
S100A1P23297 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
S100A1P23297 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
S100A1P23297 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
S100A1P23297 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
S100A1P23297 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
S100A1P23297 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
S100A1P23297 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
S100A1P23297 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
S100A1P23297 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
S100A1P23297 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
S100A1P23297 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
S100A1P23297 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
S100A1P23297 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
S100A1P23297 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
S100A1P23297 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
S100A1P23297 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
S100A1P23297 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
S100A1P23297 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
S100A1P23297 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
S100A1P23297 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
S100A1P23297 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
S100A1P23297 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
S100A1P23297 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
S100A1P23297 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
S100A1P23297 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
S100A1P23297 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
S100A1P23297 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
S100A1P23297 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
S100A1P23297 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
S100A1P23297 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
S100A1P23297 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
S100A1P23297 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
S100A1P23297 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
S100A1P23297 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
S100A1P23297 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
S100A1P23297 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
S100A1P23297 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
S100A1P23297 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
S100A1P23297 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
S100A1P23297 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
S100A1P23297 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
S100A1P23297 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
S100A1P23297 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
S100A1P23297 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
S100A1P23297 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
S100A1P23297 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
S100A1P23297 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
S100A1P23297 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
S100A1P23297 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
S100A1P23297 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
S100A1P23297 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
S100A1P23297 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
S100A1P23297 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
S100A1P23297 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
S100A1P23297 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
S100A1P23297 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
S100A1P23297 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
S100A1P23297 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
S100A1P23297 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
S100A1P23297 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
S100A1P23297 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
S100A1P23297 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
S100A1P23297 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
S100A1P23297 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
S100A1P23297 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
S100A1P23297 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
S100A1P23297 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
S100A1P23297 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
S100A1P23297 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
S100A1P23297 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
S100A1P23297 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
S100A1P23297 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
S100A1P23297 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
S100A1P23297 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
S100A1P23297 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
S100A1P23297 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
S100A1P23297 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
S100A1P23297 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
S100A1P23297 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
S100A1P23297 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
S100A1P23297 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
S100A1P23297 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
S100A1P23297 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
S100A1P23297 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
S100A1P23297 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
S100A1P23297 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
S100A1P23297 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
S100A1P23297 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
S100A1P23297 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms