Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD247P20963 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CD247P20963 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD247P20963 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD247P20963 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD247P20963 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD247P20963 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD247P20963 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD247P20963 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD247P20963 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD247P20963 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD247P20963 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD247P20963 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CD247P20963 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD247P20963 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD247P20963 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD247P20963 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD247P20963 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD247P20963 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD247P20963 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD247P20963 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD247P20963 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD247P20963 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD247P20963 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD247P20963 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD247P20963 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD247P20963 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD247P20963 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD247P20963 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD247P20963 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD247P20963 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD247P20963 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD247P20963 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD247P20963 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD247P20963 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD247P20963 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD247P20963 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD247P20963 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD247P20963 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CD247P20963 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD247P20963 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD247P20963 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD247P20963 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD247P20963 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD247P20963 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD247P20963 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD247P20963 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD247P20963 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD247P20963 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD247P20963 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD247P20963 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD247P20963 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD247P20963 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD247P20963 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD247P20963 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD247P20963 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD247P20963 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD247P20963 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CD247P20963 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD247P20963 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD247P20963 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD247P20963 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD247P20963 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD247P20963 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD247P20963 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CD247P20963 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CD247P20963 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD247P20963 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD247P20963 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD247P20963 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD247P20963 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CD247P20963 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD247P20963 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD247P20963 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD247P20963 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD247P20963 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD247P20963 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD247P20963 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD247P20963 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD247P20963 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD247P20963 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD247P20963 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD247P20963 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CD247P20963 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD247P20963 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD247P20963 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD247P20963 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD247P20963 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD247P20963 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD247P20963 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD247P20963 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD247P20963 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD247P20963 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD247P20963 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD247P20963 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD247P20963 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD247P20963 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD247P20963 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD247P20963 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD247P20963 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms