Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT15P19012 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT15P19012 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT15P19012 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT15P19012 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT15P19012 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT15P19012 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT15P19012 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT15P19012 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT15P19012 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT15P19012 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT15P19012 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT15P19012 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT15P19012 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT15P19012 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT15P19012 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT15P19012 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT15P19012 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT15P19012 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT15P19012 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT15P19012 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT15P19012 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT15P19012 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT15P19012 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT15P19012 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT15P19012 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT15P19012 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT15P19012 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT15P19012 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT15P19012 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT15P19012 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT15P19012 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT15P19012 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT15P19012 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT15P19012 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT15P19012 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT15P19012 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT15P19012 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT15P19012 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT15P19012 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT15P19012 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT15P19012 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT15P19012 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT15P19012 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT15P19012 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT15P19012 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT15P19012 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT15P19012 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT15P19012 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT15P19012 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT15P19012 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT15P19012 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT15P19012 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT15P19012 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT15P19012 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT15P19012 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT15P19012 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT15P19012 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT15P19012 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT15P19012 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT15P19012 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT15P19012 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT15P19012 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT15P19012 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT15P19012 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT15P19012 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT15P19012 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT15P19012 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT15P19012 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT15P19012 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT15P19012 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT15P19012 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT15P19012 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT15P19012 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT15P19012 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT15P19012 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT15P19012 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT15P19012 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT15P19012 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT15P19012 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT15P19012 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT15P19012 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT15P19012 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT15P19012 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT15P19012 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT15P19012 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT15P19012 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT15P19012 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT15P19012 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT15P19012 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT15P19012 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT15P19012 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT15P19012 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT15P19012 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT15P19012 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT15P19012 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT15P19012 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT15P19012 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT15P19012 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT15P19012 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms