Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRAFP15056 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRAFP15056 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRAFP15056 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRAFP15056 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRAFP15056 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRAFP15056 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRAFP15056 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRAFP15056 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRAFP15056 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRAFP15056 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRAFP15056 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRAFP15056 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BRAFP15056 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRAFP15056 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRAFP15056 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRAFP15056 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRAFP15056 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRAFP15056 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BRAFP15056 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRAFP15056 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRAFP15056 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRAFP15056 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRAFP15056 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRAFP15056 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRAFP15056 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRAFP15056 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRAFP15056 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRAFP15056 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRAFP15056 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRAFP15056 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRAFP15056 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRAFP15056 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRAFP15056 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRAFP15056 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRAFP15056 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRAFP15056 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BRAFP15056 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRAFP15056 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRAFP15056 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRAFP15056 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRAFP15056 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BRAFP15056 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRAFP15056 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRAFP15056 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRAFP15056 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRAFP15056 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRAFP15056 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRAFP15056 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRAFP15056 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRAFP15056 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRAFP15056 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRAFP15056 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRAFP15056 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRAFP15056 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRAFP15056 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BRAFP15056 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRAFP15056 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRAFP15056 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRAFP15056 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRAFP15056 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRAFP15056 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRAFP15056 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRAFP15056 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRAFP15056 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRAFP15056 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BRAFP15056 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRAFP15056 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRAFP15056 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRAFP15056 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRAFP15056 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRAFP15056 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRAFP15056 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRAFP15056 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRAFP15056 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRAFP15056 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRAFP15056 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRAFP15056 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRAFP15056 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRAFP15056 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRAFP15056 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRAFP15056 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRAFP15056 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRAFP15056 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRAFP15056 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRAFP15056 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRAFP15056 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRAFP15056 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRAFP15056 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRAFP15056 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRAFP15056 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRAFP15056 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRAFP15056 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRAFP15056 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRAFP15056 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRAFP15056 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRAFP15056 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BRAFP15056 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRAFP15056 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRAFP15056 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms