Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKIP12755 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKIP12755 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKIP12755 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKIP12755 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKIP12755 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKIP12755 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKIP12755 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKIP12755 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKIP12755 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKIP12755 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKIP12755 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKIP12755 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKIP12755 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKIP12755 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKIP12755 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKIP12755 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKIP12755 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKIP12755 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKIP12755 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKIP12755 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKIP12755 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKIP12755 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKIP12755 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKIP12755 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKIP12755 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKIP12755 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKIP12755 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKIP12755 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKIP12755 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKIP12755 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKIP12755 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKIP12755 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKIP12755 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SKIP12755 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKIP12755 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKIP12755 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKIP12755 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SKIP12755 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SKIP12755 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKIP12755 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKIP12755 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SKIP12755 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SKIP12755 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SKIP12755 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKIP12755 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKIP12755 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKIP12755 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKIP12755 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKIP12755 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKIP12755 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKIP12755 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SKIP12755 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKIP12755 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKIP12755 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKIP12755 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SKIP12755 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKIP12755 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKIP12755 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKIP12755 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKIP12755 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKIP12755 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKIP12755 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SKIP12755 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKIP12755 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKIP12755 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKIP12755 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKIP12755 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKIP12755 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKIP12755 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKIP12755 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKIP12755 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKIP12755 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKIP12755 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKIP12755 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKIP12755 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKIP12755 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKIP12755 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKIP12755 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKIP12755 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKIP12755 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKIP12755 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKIP12755 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKIP12755 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKIP12755 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKIP12755 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKIP12755 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKIP12755 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKIP12755 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SKIP12755 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SKIP12755 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKIP12755 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKIP12755 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SKIP12755 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKIP12755 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKIP12755 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKIP12755 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKIP12755 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKIP12755 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SKIP12755 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms