Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMP1P11279 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms