Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PF4V1P10720 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PF4V1P10720 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms