Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBSLP0DN79 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBSLP0DN79 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms