Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRCP08575 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms